Uluslararası kategoride proje bulunamadı!
Nöral Progenitör Hücrelerin Transfeksiyon Etkinliğinin Araştırılması
Nörogenez, merkezi sinir sisteminde kök hücre özelliğindeki hücrelerin uygun şartlarda olgun ve işlevsel nöronlara (post-mitotik nöronlar) dönüştüğü normal bir süreçtir. Bu süreç embriyonik ve yetişkin nörogenez olarak ayrı ayrı incelenmektedir. Literatürde, yetişkin nörogenez ile ilgili bir çok çalışma bulunmasına rağmen bu sürecin biyolojik işleyişi, hala tam olarak anlaşılmamıştır. Bunun yanında, Alzheimer ve Parkinson gibi bazı hastalıklarda yetişkin nörogenezin sekteye uğradığı bilinmektedir. Ancak bu gibi nörodejeneretif hastalıkların altında yatan moleküler mekanizmaların ayrıntılı bir şekilde anlaşılabilmesi için daha fazla sayıda çalışmaya ihtiyaç duyulmaktadır. Son yıllarda gen manipülasyon araçların geliştirilmesi ve in-vitro ortamda uygulanabilme kolaylığı sayesinde nörodejeneretif hastalıkların moleküler mekanizmasının aydınlatılmasında bir çok sorunun da cevaplanmasına imkan sağlamaktadır. Bu proje ile amacımız, literatürde yeni yeni çalışılmaya başlanan ve Parkinson hasta dokusundan alınarak nöral progenitör hücre hattı haline dönüştürülmüş hücrelerin (DYS0530 hücre hattı) transfeksiyon etkinliğini ölçmeye çalışmak ve laboratuarımızda bir platform oturtarak ileride gerçekleştirilmesi hedeflenen projelerle gen manüplasyon araçlarını daha etkili bir şekilde kullanmaktır.
17.07.2023 – AYLA BATU ÖZTÜRK, NAİL CAN ÖZTÜRK, DERYA YETKİN
Nöral progenitör ve LUHMES hücrelerinin farklanma profillerinin metabolom yaklaşımı ile karşılaştırılması
Parkinson Hastalığı ile ilgili biyomarkır geliştirilmesi, yeni veya mevcut ilaç adaylarının test edilmesi için mevcut in-vitro modellerin güvenirliği halen istenilen seviyede değildir. Bu çalışmada, sağlıklı mezensefalon dokusu kaynaklı ve dopaminerjik nöronlara dönüşme kapasitesi bilinen LUHMES hücreleri ve bir Parkinson Hastası'nın derisinden elde edildikten sonra önce uyarılmış pluripotent kök hücrelere ve sonrasında ise nöral progenitör hücre formuna dönüştürülmüş nöral progenitör hücreler kullanılacaktır. İki ayrı profile sahip insan genomunu temsil eden iki farklı hücre kendilerine özgü farklanma protokolleri ile nöronal forma dönüştürüldükten sonra metabolik farklılıklarının incelenmesi için LS/MS/MS yöntemi ile metabolom analizine tabi tutulacaktır. Tüm metabolom analizi ile elde edilecek verilerin biyoenformatik olarak işlenmesiyle PH modeli olarak bir arada kullanılabilecek bu iki değerli hücrenin metabolik farklılıkları irdelenecektir.
10.07.2023 – NAİL CAN ÖZTÜRK, AYLA BATU ÖZTÜRK, DERYA YETKİN
İnsan erişkin kadavralarında SMAS ve yüz derisinin biyomekanik ve histolojik özellikleri
22.11.2019 – ALEV BOBUŞ ÖRS, AYLA BATU ÖZTÜRK, ORHAN BEGER, ZELİHA KURTOĞLU OLGUNUS
İyonize Edici Radyasyonun Neden Olduğu Nöral Hücre Hasarının Epigenetik Olarak Düzeltilmesi
01.11.2019 – AYLA BATU ÖZTÜRK, BANU COŞKUN YILMAZ
Öğrenme Fonksiyonuyla İlişkili Önemli Genlerin Ekspresyonlarının Epiegentik Olarak Arttırılması
Öğrenme ve hafıza fonksiyonları memeli beynin en gizemli fonksiyonlarının başında gelmekle birlikte bozulması durumunda çok geniş yelpazede sağlık problemlerine yol açmaktadır. Özelikle öğrenmenden öncül olarak sorumlu beyin bölgesi olan hipokampus tabakalarında bazı kilit genlerinin ekspresyon dinamikleri, öğrenme ve hafıza fonksiyonunu yürütmektedir. Bu genlerin ekspresyonlarının yaşlanmayla birlikte azaldığı ve Alzheimer gibi hastalıklarda tamamen kaybolduğu bilinmektedir. Öte yandan, memelilerde gen ekspresyonlarını kontrol ettiği bilinen epigenetik mekanizmaların bu önemli hafıza genlerini de yönettiği bilinmektedir. Bu çalışmada söz konusu önemli olan genlerden iki tanesi seçilerek (c-fos, arc) bu genlerin nöron kültürü ortamında epigenomik müdahale yöntemiyle arttırılması planlanmıştır. İşlemin başarısı ve kalitesi konfokal görüntüleme, immünositokimya, RT-PCR dahil çeşitli yöntemlerle sınanacaktır. Bu genlerin in-vitro olarak ekspresyonlarının arttırıldığının teyit edilebilmesi ise aynı genlerin ekspresyonlarının deney hayvanları hipokampus’ünde de arttırılması açısından temel bir çalışma platformu oluşturacaktır.
02.01.2018 – 01.03.2023 TURAN KOÇ, AHMET HAKAN ÖZTÜRK, NAİL CAN ÖZTÜRK, AYLA BATU ÖZTÜRK
Epigenetik Müdahale Yöntemleriyle Nörogenez Hızının Arttırılması
01.09.2019 – 01.02.2023 AYLA BATU ÖZTÜRK, AHMET HAKAN ÖZTÜRK, NAİL CAN ÖZTÜRK, ŞAKİR NECAT YILMAZ, ÇAĞATAY TARHAN
Erişkin Hipokampal Nörogenez’indeki Farklılaşma Basamaklarında DNA Metilasyon Dinamiklerinin Rolünün Araştırılması
01.02.2017 – 01.08.2019 AHMET HAKAN ÖZTÜRK, AYLA BATU ÖZTÜRK, NAİL CAN ÖZTÜRK, ÇAĞATAY TARHAN, ŞAKİR NECAT YILMAZ, GÜLSEN BAYRAK
Polikistik Over Sendromu Oluşturulmuş Sıçanlarda Uterin Kontraktilitede RhoA/Rho-Kinazın Rolü
Polikistik Over Sendromu
15.05.2016 – 15.05.2017 SAVAŞ AKTAŞ, AYLA BATU ÖZTÜRK, İSMAİL ÜN, İBRAHİM ÖMER BARLAS