Uluslararası kategoride proje bulunamadı!
Dirençli Mycobacterium tuberculosis Klinik İzolatlarındaki Efluks Pompa Genlerinin ve İnhibitörlerinin Araştırılması
M. tuberculosis’te ilaç direnci, başlıca, ilaç hedefi olan veya ilacı aktive edici enzimleri kodlayan genlerdeki spontan kromozomal mutasyonlara bağlı gelişse de, direnç, sadece bu mutasyonlarla açıklanamamaktadır. Hücre duvar geçirgenliğinin düşük olması, inaktive edici enzimler ve özellikle efluks (dışa atım) pompaları mikobakte¬rilerde ilaç direncine neden olan diğer mekanizmalardır. M. tuberculosis’te ATP-Binding Cassette (ABC), Major Facilitator super family (MFS), Resistance-Nodulation-Division (RND), Small Multidrug Resistance (SMR) ailelerine ait efluks pompaları bulunmuştur. Efluks pompa inhibitor (EPİ)’leri, dışa atımı önlemek için bakteriyel efluks pompalarına bağlanan moleküllerdir. M.tuberculosis efluks pompalarına bağlanan EPİ’lerin, anti-TB ilaçların dışa atımını engellediği, M.tuberculosis’nin öldürülmesini artırdığı, ilaç direncini azalttığı ve birinci seçenek ilaçlar ile sinerjik etki yarattığı gösterilmiştir. Bu nedenle, dışa atım kaynaklı direncin önlenmesi için, geleneksel anti-TB ilaçlar ile kombine kullanılacak EPİ’lere ihtiyaç vardır. EPİ olarak Amerikan Gıda ve İlaç Dairesi tarafından sadece “Bedaquiline” ve “Verapamil” (VER) onay almasına rağmen Karbonil Siyanür m-Klorofenilhidrazon (CCCP), fenotiazinler, Rezerpin (RES) ve piperin gibi bazı EPİ’ler umut verici in vitro etkiler göstermiştir. Fakat bu ilaçların in vivo, in vitro ve yan etkileri hakkında daha fazla araştırma yapılması gereklidir. Bu çalışmada, birinci seçenek anti-TB ilaçların hepsine dirençli M.tuberculosis klinik izolatlarında, dirence neden olabilecek ABC, MFS ve RND ailesine ait toplam 21 efluks pompa geninin ekspresyonun ve VER'in Minimum İnhibitör Konsantrasyonu (MİK) üzerine etkilerinin araştırılması amaçlanmıştır.
01.04.2019 – 01.10.2020 DİDEM ÖZGÜR, MAHMUT ÜLGER, GÖNÜL ASLAN, SEDA TEZCAN ÜLGER
SARI KANTORON ÇIÇEGI (HYPERICUM PERFORATUM L. ) VE ALOE VERA BITKILERINDEN ELDE EDILEN BITKI EKSTRAKTLARININ IN VITRO ANTILEISHMANIAL AKTIVITELERININ ARAŞTIRILMASI
SARI KANTORON ÇIÇEGI (HYPERICUM PERFORATUM L. ) VE ALOE VERA BITKILERINDEN ELDE EDILEN BITKI EKSTRAKTLARININ IN VITRO ANTILEISHMANIAL AKTIVITELERININ ARAŞTIRILMASI
01.04.2019 – 01.04.2020 SEDA TEZCAN ÜLGER, EFDAL OKTAY GÜLTEKİN, AHMET MURAT GİZİR, MAHMUT ÜLGER, ERDAL YABALAK, NURAN DELİALİOĞLU, GÖNÜL ASLAN
Tüberküloz Hastalarında SOCS-1 Gen Polimorfizmlerinin Araştırılması
01.01.2018 – 06.01.2020 AHMET ATA ÖZÇİMEN, GÖNÜL ASLAN, LEYLA ERSOY
Primer Anti-Tüberküloz İlaçlara Dirençli ve Duyarlı Mycobacterium tuberculosis İzolatlarında Pirazinamid Direnci ile İlişkili pncA, rpsA ve panD Gen Mutasyonlarının Araştırılması
Pirazinamid (PZA) nikotinamidin sentetik pirazin analoğu olup, duyarlı ve çok ilaca dirençli (ÇİD)-tüberküloz (TB) tedavi rejiminde diğer ilaçlar ile kombine kullanılan önemli bir primer anti-TB ilaçtır. Tüberküloz tedavi süresini izoniazid (INH) ve rifampisin (RIF) ile birlikte 9-12 aydan 6 aya düşürmesi ve diğer anti-TB ilaçlardan farklı olarak makrofaj fagolizozomlarındaki ‘’semi-dormant’’ basil grubunu öldürerek in vivo sterilizan etki göstermesi ile kritik rol oynamaktadır. Mikobakterilerin PZA’ya duyarlılığı pirazinamidaz (PZAse) enziminin varlığına bağlıdır. Pirazinamid, mikobakteri hücre duvarından pasif difüzyon ile girdikten sonra 561 nükleotid uzunluğundaki pncA geni tarafından kodlanan pirazinamidaz PZase/nikotinamidaz enzimi tarafından aktif formdaki pirazinoik asit (POA)’te çevrilir. Bu nedenle mikobakterilerde primer PZA direnç mekanizması, PZAse aktitesinin kaybolmasına veya azalmasına neden olan pncA geninde meydana gelen mutasyonlardan kaynaklanmaktadır. Mutasyonlar pncA geninde çok çeşitli ve değişik bölgelerde görülmekle birlikte, PZase enziminin katalitik bölgeleri (Asp8, Lys96 ve Cys138) ve metal bağlama alanlarını(Asp49, His51 ve His71) içeren 3-17, 61-85, 132-142 kodonları arasında kalan üç bölgede kümelenmiştir. Ayrıca, pncA mutasyonu olmayan PZA dirençli Mycobacterium tuberculosis (M.tuberculosis) izolatlarında; trans-translasyonda rol oynayan ribozomal protein S1 (RpsA, Rv1630) geninde, aspartat dekarboksilaz kodlayan kodlayan panD geninde ve ATP'ye bağlı substrat açılımını ve ClpP1/P2 komplekslerine translokasyonu katalize eden ClpC1 proteininde meydana gelen mutasyonlar direnç ile ilişkilendirilmiştir. Klinik ve Laboratuvar Standartları Enstitüsü (Clinical and Laboratory Standards Institutes, CLSI), PZA’yı duyarlılık testinde ilk çalışılması gereken anti-TB ilaçlar arasında bildirmesine rağmen, Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ) direnç için rutin test edilecek antimikobakteriyel ilaç grubuna dahil etmemektedir. Çünkü, anti-TB ilaçların duyarlılık testinde referans yöntem olarak kullanılan agar proporsiyon yöntemi ile besiyerinin pH’sını PZA’nın aktivite gösterebileceği ve mikobakterilerin üreyebileceği bir düzeyde tutmak zor olduğundan dolayı yanlış sonuçlara neden olmaktadır. Günümüzde PZA duyarlılığının belirlenmesinde Amerikan Gıda ve İlaç Dairesi (Food and Drug Administration, FDA) tarafından onay alan VersaTREK MYCO TB (TREK Diagnostics) ve BACTEC MGIT 960 (Becton-Dickinson) olmak üzere 2 sistem bulunmaktadır. Ayrıca, PZA direncini belirlemede alternatif olarak Wayne tarafından geliştirilen kolorimetrik PZAse enzim testi de kullanılmaktadır. Planlanan bu projede PZA dirençli M. tuberculosis izolatlarında; direnç ile ilişkilendirilen pncA, rpsA ve panD gen mutasyonlarının, PZAse enzim testinin etkinliğinin ve ilaç duyarlılıklarına göre PZA direnç oranlarının belirlenmesi amaçlanmıştır.
01.01.2017 – 01.07.2018 GÖNÜL ASLAN, DİDEM ÖZGÜR
Kutanöz Leishmaniasis Hastalarında Sitokin Gen Polimorfizmi ve Genetik Yatkınlık. Protokol
MERSİN ÜNİVERSİTESİ 01.01.2013 – 30.06.2016 GÖNÜL ASLAN, FATMA ESİN KIRIK
TÜRKİYE ROTAVİRÜS SÜRVEYANS AĞI (TÜROSA)
1.THSK, Mikrobiyoloji Referans Laboratuvarları Dairesi Başkanlığının sorumluluğunda Türkiye Rotavirus Sürveyans Ağının (TÜROSA) kurulması.2.Aşılama öncesi süreçte Akut gastroenterit (AGE) nedeniyle hastaneye yatırılan ve/veya AGE nedeniyle acilde gözlem altında tutulan 5 yaş altı çocuklarda rotaviruslara bağlı AGE ve ölüm oranlarının belirlenmesi. 3. 5 yaş altı AGE’li çocuklarda Rotavirus G/P tiplerinin belirlenmesi4. Aşı öncesi süreçte Rotavirus G/P tiplerinin ortaya konulmasıyla mevcut aşıların ülkemizdeki suşları kapsayıcılığı konusunda bilimsel veri ortaya konulması.5.Aşı öncesi ve aşı sürecinde RV’lara bağlı gastroenteritlerin sıklığı ve G/P tiplerinin dağılımının tespiti ile aşı etkinliğinin değerlendirilmesi.
01.10.2012 – 01.05.2016 RIZA DURMAZ, MEHMET ALİ TORUNOĞLU, YAVUZ UYAR, AHMET ÖZLÜ, PERVİN ÖZELÇİ, ATİLLA KALAYCIOĞLU, ZEKİYE BAKKALOĞLU, GÜLAY KORUKLUOĞLU, FEHMİNAZ TEMEL, GÖNÜL TANIR, ASUMAN ŞAMLI, ERDAL İNCE, HALİL ÖZDEMİR, HALUK GÜRİZ, GÜLENDAM BOZDAYI, HASAN TEZER, SELMA GÖKAHMETOĞLU, MEHMET ADNAN ÖZTÜRK, GÜL DURMAZ, BANU BAYRAKTAR, NAZAN DALGIÇ, ELİF AKTAŞ, BETİGÜL ÖNGEN, AYPER SOMER, SEBAHAT AKSARAY, ÇAĞATAY NUHOĞLU, RIZA ADALETİ, MUSTAFA KEMAL HACIMUSTAFAOĞLU, BEYZA ENER, RECEP KEŞLİ, AYŞEGÜL BÜKÜLMEZ, EYLEM ULAŞ SAZ, CANDAN ÇİÇEK, İLKER DEVRİM, SÜLEYMAN NURİ BAYRAM, SELDA SORGUÇ, MURAT ANIL, DİLEK YILMAZ, EMİNE KOCABAŞ, ÖZLEM ÖZGÜR GÜNDEŞLİOĞLU, ÜMİT ÇELİK, AYGEN YILMAZ, DERYA MUTLU, ALİ OSMAN ŞEKERCİOĞLU, EMEL SESLİ ÇETİN, SEDA TEZCAN, NURAN DELİALİOĞLU, HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU, OĞUZ TUNCER, HAKAN USLU, FATMA BACALAN, TEKİN KARSLIGİL, NİLGÜN ÇÖL, FARUK AYDIN, EROL ERDURAN, SELÇUK KILIÇ, ALPER KARAGÖZ, ÖZLEM ÜNALDI, MUSTAFA ERTEK, SÜMEYRA ACAR, AYSEN BAYRAM, EKREM YAŞAR, MUSTAFA ALTINDİŞ, BANU BAYRAKTAR, FERDA AKTAŞ, ÖMER KILIÇ, CÜNEYT ÖZAKIN, SOLMAZ ÇELEBİ, GÖNÜL ASLAN, ESİN ARK, EBRU SÖZEN, ÖZKAN ŞENGÜL, HÜLYA ZARARSIZ, METEHAN ÖZEN, BİLGE ALDEMİR KOCABAŞ, ZAFER ÇETİNKAYA, HALUK VAHABOĞLU, FİGEN TEMEL KELESYAN, ZÜMRÜT SAHBUDAK, SEMRA ŞEN, NURİ ZAFER KURUGÖL, CAFER EROĞLU, AHMET GÜZEL, BAHADIR FEYZİOĞLU, MELİKE EMİROĞLU, FADİLE YILDIZ ZEYREK, ALPAY ÇAKMAK, MUKADDER AYŞE SELİMOĞLU, ÇİĞDEM KUZUCU, AHMET SOYSAL, MUSTAFA BAKIR, AYŞEGÜL YAĞCI
Tüberküloz Hastalarında Plazma MikroRNA Seviyelerinin Belirlenmesi
Tüberküloz Hastalarında Plazma MikroRNA Seviyelerinin Belirlenmesi
MERSİN ÜNİVERSİTESİ 15.06.2014 – 15.06.2015
BAP SBE TM ŞG 2010 5 YL
Hematolojik Maligniteli Hastalarda Parvovirüs 4 Parvovirüs 5 ve İnsan Bocavirüs Varlığının Araştırılması
–
BAP SBE TM MÜ 2010 4 DR
Tüberküloz Hastalarında Sitokin Gen Polimorfizmi ve Genetik Yatkınlık
–
BAP TF TTB GA 2010 4 GP
Hastane Enfeksiyonu Etkeni Olan Mikroorganizmaların Hızlı Moleküler Epidemiyolojik Tanısı
–
BAP ECZ F TEB AD 2010 5 A
Candida glabrata nın moleküler epidemiyolojisi ön çalışma
–
BAP TF TTB MY 2010 4 TU
Yenidoğan Dışı Menenjit Şüpheli Hastalarda Bakteriyel Menenjit Etkenlerinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması
–
BAP SBE TM SK 2010 5 YL
Kan Donörlerinde Dengue Virus Varlığının Serolojik Olarak Araştırılması
–
BAP SBE TM ŞD 2008 10 DR
Klinik örneklerde küf mantarlarının klasik ve moleküler yöntemlerle araştırılması ve antifungal duyarlılıklarının belirlenmesi
–
BAP SBE TM ÇY 2008 9 DR
Mersin İlindeki Bakteriyel gastroenterit etkenlerin klasik ve moleküler yöntemlerle araştırılması
–
BAP SBE TM ST 2008 9 DR
Hepatit B virüsü HBV ile kronik infekte hastalarda HBV bazal kor promoter prekor gen mutasyonları ve genotip değerlendirilmesi
–
BAP SBE FM FEB 2007 1 YL
Kronik Hepatit B li Hastaların Adefovir Tedavisi Sırasında HBV Polimeraz Geninde Gelişen Ve Adefovire Karşı Direnç Oluşumuna Sebep olan Mutasyonların Dizi Analizi ile Araştırılması
–
BAP ECZ F FM MSS 2007 2
Kronik Hepatit B li Hastalarda Lamivudin Adefovir ve Entecavir ile Tedavi Süresince Ortaya Çıkan ve İlaç Direncine Sebep Olan HBV Polimeraz Gen Mutasyonları ile bu Mutasyonların HBV Core ve Pre Core Bölgesinde Ortaya Çıkan e minus Mutasyonları ile olan Muhtemel İlişkisinin araştırılması
–
BAP SBE FMA EK 2010 1 YL
HBV X HBx genindeki Hepatosellüler karsinoma ile muhtemel ilişkisi olan mutasyonların retrospektif olarak araştırılması
–
BAP SBE TM FEA 2007 1
Süt ve Süt Ürünlerinde Brucella Cinsi Bakterilerin Araştırılması
–
BAP SBE TM MÜ 2007 1 YL
Mersin İlinde İzole Edilen Streptomisin Dirençli Mycobacterium Tuberculosis Kompleksi Klinik İzolatların rpsL ve rrs Gen Bölgesi Mutasyonlarının Dna Dizi Analizi ile araştırılması
–
BAP TF DTB FO 2007 2
Ev Ortam Havasındaki Küf ve Mayaların ve Ev Karekteristiklerinin Çocuklarda Allerjik Astımla İlişkisi
–
BAP TF TTB GB 2006 I
Mikobakteri Türlerinin İdentifikasyonu için PCR RFLP Parça Uzunluk Polimorfizmi Tekniği ve Klasik Yöntemlerin Uygulanması
–
BAP TF TTB FO 2006 1
İnvaziv Candida İnfeksiyonunun Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Tanısı
–
BAP TF TTB GE 2004 3
İlimizde Kronik C Hepatitine Sebep Olan Hepatit C HCV Virüsünün Genotiplendirilmesi
–
BAP TF DTB AK 2006 1
Semptomatik hastalarda ve asemptomatik bireylerde HSV 1 ve HSV 2 pozitifliklerinin belirlenmesi
–
BAP SHMYO SP GA 2006 1
Mersin İline Bağlı Karaduvar Mahallesindeki İçme Su Kaynaklarında Crytosporidium Ookistlerinin Araştırılması
–
BAP TF DTB KB 2006 1
5 575
–
BAP TF TTB GE 2006 1
Mersin İlinde Hepatit B Ve Hepatit Cli Hastalarda Sen Virus Prevalansi
–
BAP TF TTB GA 2006 1
Klinik Örneklerden İzole Edilen Streptococcus Pneumonie İzotlarında Penisilin Direncinin Klasik ve molekiler Yöntemlerle Belirlenmesi
–
BAP TF DTB ACY 2005 2
Döküntülü Hastalarda Parvovirus B19 İnfeksiyonu Prevalansı
–
BAP TF TTB GA 2004 3
Mycobacterium tuberculosis in antitüberküloz ilaçlara duyarlılıklarının belirlenmesinde BACTEC ve moleküler tanı yöntemlerinin karşılaştırılması
–
BAP TF TTB GA 2004 2
5 10 Yaş Grubu Çocuklarında Üst Solunum Yolunda İzole Edilen Streptococcus Pnemonia Suşlarının Serotiplendirilmesi
–
BAP TF DTB AY 2004 3
Myelodysplastic Sendromda P15INK4B Promotor Bölgesindeki Metilasyonun Tesbiti ile Metilasyonun Muhtemel EBV İnfeksiyonu ile İlişkisinin Araştırılması
–
BAP TF TTB GE 2004 2
İlimizde Kutanöz Leismaniasis Etkeni İzalosyonu ve Seroprevalansı
–
BAP ECZ F TEB MSS 2004 3
Kronik Hepatit B li Hastaların Tedavisi Sırasında HBV Polimeraz Geninde Gelişen Mutasyonların Dizi Analizi Metodu ile Araştırılması
–
BAP TF TTB FO 2004 3
Havadan bulaşan küf mantarlarının hastane kaynaklı infeksiyonlar bakımından değerlendirilmesi
–
BAP TF DTB GS 2010 3 TU
Hastane enfeksiyonu etkeni olan pseudomanas aeruginosa suşlarinda karbapenem direnci ve direncin molekuler olarak saptanmasi
–
BAP TF TTB GA 2011 4 GP
MODS Yöntemi ile Tüberküloz Hızlı Tanısı
–
BAP SBE FM ZÖ 2011 5 YL
Hepatit C virüsü HCV ile kronik infekte sirozlu hasta tam kan örneklerinde HCV ve hepatosellüler karsinoma ile ilişkili miRNA ların ekspresyon profillerinin araştırılması
–
BAP TF CTB VAM 2011 4 TU
Servikal Smear Anormalliği Olan Hastalarda Human Papilloma Virus HPV un Varlığın Araştırılması ve Genotiplendirilmesi
–
BAP SBE TM DÖ 2011 7 YL
Normal Servikal Sitoloji Bulgularına Sahip Kadınlarda Genital Human Papilloma Virus HPV un Araştırılması ve Genotiplerinin Belirlenmesi
–
BAP SBE TM HG 2011 5 YL
Hastane Enfeksiyonu Etkeni Olarak Acinetobacter baumannii Epidemiyolojisinin Rep PCR ile Araştırılması
–
BAP TF TTB ST 2011 5 GP
Solunum Yolu Viral Enfeksiyonlarının Etiyopatogenezi
–
BAP SBE TM İG 2011 7 YL
Hastane Enfeksiyon Etkeni Olarak Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus Epidemiyolojisinin Rep PCR ile Araştırılması
–
BAP TF DTB İA 2011 4 TU
Riketsiyöz Seroprevalans Araştırılması
–