Understanding the origin of complex multicellular animals through cell type evolution

Tek hücreden çok hücreli yaşam formuna geçiş sürecinin araştırılması

MERSİN ÜNİVERSİTESİ 11.03.2016 –

Devam Ediyor Diğer (Uluslararası) Proje Hakemliği

The role of self non self recognition in the transition from unicellular to multicellular life and in the persistence of complex multicellular life on earth

Tek hücreli yaşam formundan çok hücreli yaşam formuna geçiş sürecinin araştırılması

MERSİN ÜNİVERSİTESİ 11.03.2016 –

Devam Ediyor Diğer (Uluslararası) Proje Hakemliği

Tunçtan B Buharalıoğlu C K Serin M S Şahan Fırat S Korkmaz B Cüez T Sari A N Endotoksemik sıçanların kardiyak renal ve vasküler dokularında nitrik oksit sentaz siklooksijenaz ve sitokrom P450 4A enzimleri arasındaki etkileşmelerin mekanizmasının moleküler düzeyde araştırılması TÜBİTAK Projesi SBAG Mersin Proje no 109S121 Bütçe 307 170 00 TL 1 Kasım 2009 1 Kasım 2012 devam ediyor

Devam Ediyor TÜBİTAK PROJESİ Uzman

Viral Hepatit B hastalarında ilk tedavi öncesi reverse transkriptaz inhibitörü nükleosid analoğu ilaç direnç profilinin çıkarılması

Hepatit B virüsü, viral hepatit B hastalığının etkeni olan bir DNA virüsüdür. İnfeksiyon kronikleştiği zaman fibroz, siroz ve/veya hepatosellüler karsinoma gibi önemli tablolara neden olabilir. Hepatit B bulaşıcı bir hastalıktır ve halen tüm dünyada önemli bir sağlık sorunudur. Türkiye’de günümüzde her 3 kişiden yaklaşık 1’i Hepatit B virüsü ile karşılaşmıştır. Aynı zamanda her 10 kişiden 1’i Hepatit B virüsünü taşımakta ve bulaştırmaktadır. Hastaların %75-80 inde herhangi bir belirti vermeksizin gelişir, taramalarda ve kan bağışlarında yapılan tetkiklerde tesadüfen tespit edilir. Tedavisinde IV yol ile verilen interferon/ Pegile interferon veya oral yoldan verilen Lamivudin, Adefovir, Entecavir, Telbivudine, Tenofovir gibi nükleosid/nükleotid analoğu ilaçlar kullanılmaktadır. Tedavide daha çok yukarıda belirtilen oral antiviraller tercih edilmektedir. Ancak bu ilaçlara karşı HBV’nün replikasyon stratejisi ve biyolojik özelliklerinden dolayı, zamanla ilaçtan ilaca değişiklik göstermekle beraber farklı oranlarda ilaca direnç mutasyonları ortaya çıkmaktadır. Gelişen dirençli virüsler hastalardan sağlam bireylere de bulaşabilme olasılığına sahiptir. Bu nedenle ilk tedavi öncesinde de ilaç dirençli HBV ile infeksiyon olasılığı vardır. Ülkemizde uygulanan (18.02.2015 tarihli) sağlık uygulama tebliğine göre: “İlk tedaviye başlamak için; HBV DNA seviyesi 10.000 (104) kopya/ml (2.000 IU/ml) veya üzerinde olan hastalar, HBV DNA sonucu ve karaciğer biyopsi raporuna göre hastaların tedavisine interferonlar veya oral antiviraller ile başlanabilir. Oral antiviral tedaviye; Erişkin hastalarda; günde 100 mg lamivudin veya 600 mg telbivudin veya 245 mg tenofovir veya 0,5 mg entekavir ile başlanır” ifadeleri yer almaktadır. Ancak tedavi öncesi olası direnç profili bilinmeden uygulanan antiviral tedavi tamamen hekimin insiyatifine ve tecrübesine bırakılmıştır. Bu projenin hedefi; başlangıç olası direnç profilinin belirlenmesi ve buna göre tedaviye başlanması ile hem hekimlere önemli ölçüde yol gösterici olabilmek, hemde gereksiz ilaç kullanımına ve buna bağlı olarak ortaya çıkan zaman kaybı, yan etki ve ekonomik zararları önemli ölçüde minimalize edecek bulgular elde etmektir. Literatürde bu ve buna benzer çalışma sayısı son derece sınırlıdır. Bu projedeki amacımız; tedaviye başlanmamış HBV DNA’sı pozitif, olan 72 adet 18 yaş üstü viral hepatit B hastasında Lamivudin, Adefovir, Entecavir, Telbivudine, Tenofovir olası direnç profilinin tek seferde yapılacak PCR-DNA dizi analizi ile belirlenmesi ve buna bağlı olarak yukarıda belirtilen hedeflere ulaşmaya katkı sağlamaktır. Projenin ilk 8 ayında çalışma örnekleri toplanacak, satın alma işlemleri gerçekleştirilecektir. Son 6 ayında ise deneysel çalışmalar tamamlanacaktır. Klinik takipleri MEÜ. Tıp Fakültesi Hastanesi Gastroenteroloji B.Dalı kliniğinde Prof. Dr. Orhan SEZGİN tarafından yapılan, HBsAg’si pozitif, anti-HBsAg’si negatif ve HBV DNA’sı pozitif olan ve HBV DNA miktarı ve karaciğer fonksiyon testleri bakımından 6 ayda bir kontrole gelerek takip edilen ancak hiç tedavisine başlanmamış hastalardan 5 ml kan örneği alınacaktır. Bu örnekler dokt. Öğr. Arş. Gör. Zehra ÖKSÜZ tarafından teslim alınarak MEÜ. Eczacılık Fakültesi Farmasötik Mikrobiyoloji A. Dalı laboratuvarına getirilip burada serumu ayrılarak -20°C’de saklanacaktır. Bu serumlardan dokt. Öğ. Arş. Gör. Zehra Öksüz, Prof. Dr. Mehmet Sami SERİN ve Doç. Dr. Aylin DÖĞEN tarafından aynı birimde, DNA izole edilerek, HBV genomunda tüm nükleosi

01.07.2015 – 04.07.2020 MEHMET SAMİ SERİN, AYLİN DÖĞEN, ORHAN SEZGİN, ENGİN KAPLAN, ZEHRA ÖKSÜZ KARAARSLAN

Tamamlandı Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Yürütücü

Viral Hepatit B hastalarında ilk tedavi öncesi reverse transkriptaz inhibitörü nükleosid analoğu ilaç direnç profilinin çıkarılması

Hepatit B

23.06.2015 – 20.07.2017 MEHMET SAMİ SERİN, ZEHRA ÖKSÜZ

Tamamlandı Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Yürütücü

Mersin Üniversitesi Araştırma Proje Potansiyelinin Geliştirilmesi ve Sürdürülebilirliği

Mersin Üniversitesi Araştırma Proje Potansiyelinin Geliştirilmesi ve Sürdürülebilirliği

MERSİN ÜNİVERSİTESİ 01.09.2014 – 01.09.2016

Tamamlandı TÜBİTAK PROJESİ Araştırmacı

Stafilokok Kökenlerinin Transkriptomları ve Proteinleri Üzerine Çeşitli Antimikrobiyallerin Antienflamatuvar ve Analjezik Etkili Maddelerin Etkilerinin Araştırılması TÜBİTAK Proje No 114S821 29950 TL projects gorevler 6 2015 Tamamlandı

MERSİN ÜNİVERSİTESİ 01.10.2014 – 01.11.2015

Tamamlandı TÜBİTAK PROJESİ Projedeki Konumu Yok

Tüberküloz Hastalarında Plazma MikroRNA Seviyelerinin Belirlenmesi

Tüberküloz Hastalarında Plazma MikroRNA Seviyelerinin Belirlenmesi

MERSİN ÜNİVERSİTESİ 15.05.2014 – 15.05.2015

Tamamlandı TÜBİTAK PROJESİ Araştırmacı

ADAMTS 13 Eksikliğine Neden Olan İnhibitör Otoantikorların Stimülasyonunda Bazı Tropikal Viral Ve Paraziter Etkenlerin Olası Rolünün Araştırılması A Tipi BAP ECZ F FMB MSS 2010 3 A

MERSİN ÜNİVERSİTESİ 01.07.2010 – 01.07.2014

Tamamlandı ARAŞTIRMA PROJESİ Yönetici

Mersin de Sürdürülebilir Bölgesel Kalkınmaya Yönelik Bilim Ve Teknoloji Araştırma Merkezi Alt Yapısının Oluşturulması DPT alt yapı projesi

MERSİN ÜNİVERSİTESİ 01.04.2013 – 01.04.2014

Tamamlandı ARAŞTIRMA PROJESİ Yürütücü

HBV X HBx genindeki Hepatosellüler karsinoma ile muhtemel ilişkisi olan mutasyonların retrospektif olarak araştırılması Yüksek Lisans BAP SBE FMA EK 2010 1 YL

Tamamlandı DİĞER Yönetici

Merkez Laboratuvarda Bulunan Gelişmiş İleri Teknolojik Sistemlerin Çalışabilmesi İçin Ön Hazırlık Laboratuvarının Kurulması Güdümlü Alt Yapı BAP ECZ F FM MSS 2010 3 GP

Devam Ediyor DİĞER Yönetici

Kanserin Erken Tanısında Moleküler Altyapı Laboratuvarının Oluşturulması Çulurova kalkınma ajansı küçük ölçekli alt yapı projesi

Devam Ediyor DİĞER Uzman

Promoter methylation of P15 INK4B gene is possibly associated with parvovirus B19 infection in adult acute leukemias Hızlı Destek Projesi BAP ECZ TEB MSS 2009 2HD

Tamamlandı DİĞER Yönetici

YENİ BAZI BENZİMİDAZOL VE İNDOL TÜREVİ BİLEŞİKLERİN ANTİMİKROBİYAL AKTİVİTELERİNİN ARAŞTIRILMASI Yüksek Lisans BAP SBE TMAD NDY 2009 7 YL

Tamamlandı DİĞER Yönetici

Kronik Hepatit B li Hastalarda Lamivudin Adefovir Ve Entecavir İle Tedavi Süresince Ortaya Çikan Ve İlaç Direncine Sebep Olan Hbv Polimeraz Gen Mutasyonlari İle Bu Mutasyonlarin HBV Core Ve Pre Core Bölgesinde Ortaya Çikan E Minus Mutasyonlari İle Olan Muhtemel İlişkisinin Araştirilmasi B tipi BAP ECZ F FM MSS 2007 2 25 12 2007

Tamamlandı DİĞER Yönetici

Kronik Hepatit B li Hastaların Tedavisi Sırasında HBV Polimeraz Geninde Gelişen Mutasyonların Dizi Analizi Metodu ile Araştırılması BAP ECZ F TEB MSS 2004 3

Tamamlandı DİĞER Yönetici

Mycobacterium tuberculosis in antitüberküloz ilaçlara duyarlılıklarının belirlenmesinde BACTEC ve moleküler tanı yöntemlerinin karşılaştırılması BAP TF TTB GA 2004 3

Tamamlandı DİĞER Uzman

MyeLodysplastıc sendromda P15INK4B Promotor bölgesindeki metilasyonun tespiti ve metilasyonun muhtemel EBV infeksiyonu ile ilişkisinin araştırılması BAP TF DTB AY 2004 3

Tamamlandı DİĞER Uzman

İskemik kalp hastalıklarında plazma ADAMTS 13 düzeyinde aktivitesinde ve ekspresyonunda meydana gelen değişiklikler BAP TF DTB NT 2004 3

Tamamlandı DİĞER Uzman

Çukurova bölgesinde rastlanan ve tedaviye farklı cevap veren kutanöz leishmaniasis li hastalardan izole edilen suşların genetik tiplendirilmesi ve tedavinin yönlendirilmesi TF2003BAP8

Tamamlandı DİĞER Uzman

HCV 1b izolatı ile kronik infekte hastalarda tedaviye yanıtta NS5A geni ISDR de gelişen mutasyonların önemi TF2002BAP54

Tamamlandı DİĞER Uzman

Dizi analizi yöntemi ile bölgemizdeki Hepatit B Virüsü varyantlarının genotiplendirilmesi TF2002BAP56

Tamamlandı DİĞER Yönetici

HBV infeksiyonunun tedavisinde virüs ün polimeraz geninde gelişen mutasyonlar ve lamivudine kazanılan direnç mekanizmasının moleküler düzeyde tesbit edilmesi TF2002BAP55

Tamamlandı DİĞER Uzman