Uluslararası kategoride proje bulunamadı!
Antibiyofilm Ajanı Olarak Spesifik Pseudomonas aeruginosa Fajlarının İzolasyonu, Karakterizasyonu Ve Biyofilm Oluşumu Üzerine Olan İnhibe Edici Etkileri
Pseudomonas aeruginosa mortalite ve morbiditesi yüksek, tedavisi güç enfeksiyonların etkeni fırsatçı bir patojendir. P. aeruginosa biyotik ve abiyotik yüzeyler üzerinde biyofilm tabakası oluşturması nedeniyle dünyada ve ülkemizde büyük bir sağlık problemi olmaya devam etmektedir. Antibiyotik direnci oldukça fazla olan P. aeruginosa’ nın çeşitli doku ve yüzeylerde oluşturduğu biyofilm dokusuna antimikrobiyal ajanların difüze olamamasından ve konağın bağışıklık sistemine karşı dirençli olması dolayı yaşanan tedavi zorlukları biyofilm oluşumunu engelleyici bir takım uygulamalar geliştirilmesini zorunlu kılmıştır. Çalışmamızda Mersin ili ve civarındaki farklı bölgelerden toplanacak klinik, çevresel (toprak, su, kanalizasyon suyu) örneklerden Pseudomonas aeruginosa suşları izole edilecektir. Elde edilen P. aeruginosa suşlarının antibiyotiklere karşı duyarlılıkları incelenecek, değişik ortam koşulları (pH, sıcaklık, nem) altında biyofilm aktiviteleri belirlenecektir. Biyofilm oluşturan P. aeruginosa suşlarına özgü litik fajlar izole edilecek ve bakteriyofaj profilleri çıkarılarak karakterizasyonu gerçekleştirilecektir. İzole edilen bakteriyofajlar biyofilm oluşumunun engellenmesi amacıyla kullanılacaktır. Çalışmamızın amacı antibiyofilm ajanı olarak spesifik Pseudomonas aeruginosa fajlarının izolasyonu, karakterizasyonu ve biyofilm oluşumu üzerine olan inhibe edici etkilerini araştırmaktır.
01.04.2019 – 01.04.2022 GÖKHAN CORAL, GİZEM TALAŞ
Bakteriyel nanoselüloz tabanlı üç boyutlu yapay dermal deri iskelesinin sentezi, karakterizasyonu, biyo-uyumluluk ve gen ekspresyonu analizlerinin yapılması
Bakteriyel selüloz zorunlu aerob asetik asit bakterilerinin oksijence zengin yüzeye yakın olmak ve dış etkenlerden korunmak için sentezledikleri % 100 saflıkta bir nanopolimerdir. Bakteriyel selülozun en dikkat çekici özellikleri saflığı, su tutma kapasitesi, esnekliği ve biyo-uyumluluğudur. Yapılan in vivo ve in vitro biyo-uyumluluk çalışmaları bakteriyel selülozun geniş uygulama alanı bulabilecek bir yapay doku iskelesi olabileceğini göstermektedir. Bakteriyel selüloz doku iskelesi kullanılarak yapay kemik, kıkırdak, kas ve damar dokusu çalışmaları halen devam etmektedir. Çalışmamızda bakteriyel selüloz doku iskelesinin sentezlenmesi ve insan deri kök hücrelerinin (keratinosit ve fibroblast) bu doku iskelesi üzerindeki yaşayabilirliğinin değerlendirilmesi ve iki katmanlı yapay deri prototip ortaya konulması amaçlanmaktadır. Bu amaçla ev yapımı sirkeden Acetobacter sp. izole edilip 16S rRNA analizi ile tür tayini yapılacak ayrıca biyokimyasal karakterizasyonu yapılacaktır. İzole edilen bakteri sıvı Hestrin-Schramm besiyerine ekilerek statik kültür koşullarında bakteriyel selüloz sentezlemesi sağlanacaktır. 7 günlük üretim sonunda bakteriyel selüloz pelliği hasat edilip standardizasyon testlerine (su tutma kapasitesi, por çapı, su alma kapasitesi ve porosite) tabii tutulacaktır. Pellik daha sonra üç boyutlu bir doku iskelesi oluşturmak için liyofilizasyon ile dondurulup kurutulacaktır ve SEM (Scaning Electron Microscopy) görüntülemesi yapılacaktır. Ardından doku iskelesine insan keratinosit ve fibroblast hücrelerinin ekimi kısmına geçilecektir. Bu amaçla ticari hücre hatları satın alınıp en az 3 kez pasajlanıp yeterli hücre sayısı sağlandıktan sonra doku iskelesine kültür koşullarında ekimi sağlanacaktır. Hücrelerin tutunma, çoğalma ve farklılaşmasını kantitatif olarak değerlendirmek için 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide (MTT) analizi, kalitatif olarak değerlendirmek için de histolojik analizler (immohistokimyasal boyama) ileTEM (Transmission Electron Microscopy) görüntülemesi yapılacaktır. Son olarak hücre-doku iskelesi yapısından hücreler hasat edilerek mRNA izolasyonu yapılıp RT-PCR ile hücrelerin farklılaşması gen ekspresyonu düzeyinde ortaya koyulacaktır. Çalışmamız başarıya ulaştığı takdirde son derece ucuz, tamamen doğal, biyo-uyumluluğu yüksek bir yapay deri prototipi ortaya konmuş olacaktır.
03.07.2017 – 03.07.2020 GÖKHAN CORAL, PINAR KÜCE ÇEVİK, GİZEM TALAŞ