GBS ile sonuçlanan DArTseq markörleri kapsayan tüm genom aracılığıyla Türkiye yonca germplazmının genetik çeşitliliğinin ve popülasyon yapısının tanımlanması

Kaba yemler, tüm dünyada geviş getiren büyükbaş hayvanlar için temel besin kaynaklarıdır. Bu ürünlerin veriminin artırılması, hayvancılık ürünlerinin erişilebilirliğini ve satın alınabilirliğini artırırken aynı zamanda mevcut meralarda daha yüksek sürü yoğunluklarına izin vererek sınırlı arazi kaynakları üzerindeki baskıyı azaltmaktadır. Yonca (Medicago sativa L.) dünyada en yaygın yetiştirilen baklagil yem bitkisidir. Bu çok yıllık baklagil yem bitkisi, yüksek yem kalitesi ve toprak verimliliğini arttırma bakımından oldukça değerli bir bitkidir. Artan sıcaklık ve kuraklık ile karakterize edilen iklim değişikliğinin yonca üretimini önemli ölçüde etkilemesi beklenmektedir. İklim değişikliğine uyumlu yonca çeşitleri üretmek için hem biyotik hem de abiyotik çevre koşullarına karşı dayanıklı yeni genetik varyasyonların belirlenmesi ve bunların gelecekteki ıslah programları için kullanılabilirliğinin korunması kritik önem taşımaktadır. Moleküler belirteçlerin kullanımı, bitki ıslahında bir devrim yaratarak arzu edilen özelliklerin daha hassas ve verimli bir şekilde seçilmesini sağlamaktadır. Yeni Nesil Dizilemenin (NGS) ilerlemesi, DNA dizileme fiyatını önemli ölçüde düşürerek, dizileme yoluyla genotiplemeyi (GBS) yüksek genetik çeşitliliğe ve büyük genomlara sahip türler için gerçekçi bir seçenek haline getirmiştir. Bu teknoloji, çeşitli ürünlerin markör destekli seleksiyonunda başarıyla uygulanmaktadır. Bu çalışmanın amacı, DArTseq markörlerini kapsayan tüm genom aracılığıyla Türk yonca germplazmının genetik çeşitliliğini belirlemektir. Bu çalışmada, çeşitli illerden toplanan toplam 94 yonca aksesyonu bitki materyali olarak kullanılacaktır. DNA izolasyonu gerçekleştirilecek ve DNA örnekleri genotipleme ve dizileme analizi için Diversity Array Technology Pty, Ltd'ye gönderilecektir. GBS analizi sonucunda 5.000-100.0000 arasında DArTseq markörü elde edilecektir. Elde edilen markör veri seti, yüksek kaliteli ve bilgilendirici markörleri belirlemek için called oranı, PIC değeri ve yeniden üretilebilirlik gibi çeşitli parametrelerle taranacaktır. Taranan markör veri seti, gen çeşitliliği, Shanon bilgi indeksi ve beklenen heterozigotluk hesaplanarak yoncanın genetik çeşitliliğini belirlemek için kullanılacaktır. Genetik olarak farklı genotipler genetik mesafe yoluyla tanımlanacak ve elde edilen genotipler gelecekteki yonca ıslahı için aday ebeveynler olarak hizmet edecektir. Yoncanın 94 aksesyonu arasındaki genetik ilişkiyi araştırmak için popülasyon yapısı, UPGMA/komşu-birleştirme analizi ve temel koordinat analizi gibi çeşitli kümeleme algoritmaları uygulanacaktır. Bu çalışma, DArTseq markörleri aracılığıyla Türk yonca germplazmını karakterize etmeyi amaçlayan Türkiye'deki ilk çalışma olacak ve dünyadaki öncüler arasında yer alacaktır. Bu çalışma, Türk yonca germplazmındaki genetik çeşitlilik hakkında ayrıntılı bilgi sağlayacak ve elde edilen genetik ve genomik kaynaklar, gelecekte yoncanın markör destekli ıslahında yardımcı olacaktır.

26.08.2024 – MUHAMMAD TANVEER ALTAF, KAĞAN KÖKTEN, MEHMET BEDİR, MUHAMMED TATAR, MUHAMMAD AZHAR NADEEM, Faheem Shehzad Baloch, Amjad Ali, NAFİZ ÇELİKTAŞ, RECEP İRFAN NAZLI, FATİH ÖLMEZ, Sarmad Ali Qureshi

Devam Ediyor Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Yürütücü

Türkiye'ye Büyük Miktarda Girişi Sağlanan Parmak Darı Germplazmının, Genotipik Ve Fenotipik Karakterizasyonu Ve Islah Amaçlı Mini Çekirdek Koleksiyonunun Oluşturulması

01.05.2023 – CELALEDDİN BARUTÇULAR, FAHEEM SHAHZAD BALOCH, MUHAMMAD AZHAR NADEEM, MEHMET YILDIRIM, BURÇAK KAPUR, HAYRİYE YILDIZ DAŞGAN

Devam Ediyor -Tübitak 1001 Araştırmacı

Genetik çeşitliliğinin merkezi olan Türkiye ve İran’ı temsil eden domuz ayrığı (Dactylis glomerata L.) gen kaynaklarının sekanslama ile genotipleme

Yem bitkisi

14.07.2023 – 17.07.2024 NAFİZ ÇELİKTAŞ, Muhammad Tanveer Altaf, MEHMET BEDİR, EMRE AKSOY, Waqas LİAQAT, KAĞAN KÖKTEN, MUHAMMAD AZHAR NADEEM, MUHAMMED TATAR, Amjad ALİ, FAHEEM SHAHZAD BALOCH

Tamamlandı Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Araştırmacı

Islahında kullanılmak üzere küresel börülce gen kaynaklarının moleküler karaktarizasyonu

Islahında kullanılmak üzere küresel börülce gen kaynaklarının moleküler karaktarizasyonu

12.04.2021 – 12.12.2022 MUHAMMAD TANVEER ALTAF, MEHMET BEDİR, TOLGA KARAKÖY, MUHAMMAD AZHAR NADEEM, MUHAMMAD AASIM, Faheem Shehzad Baloch, AHMAD ALSALEH

Tamamlandı Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Araştırmacı